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为薏苡叶绿体基因组生物信息的开发综合应用、品种分子鉴定及种质亲缘关系分析提供参考，根据Gencbank数据库公布薏苡叶绿体基因组的DNA序列信息，利用生物信息学方法分析薏苡叶绿体基因组的SSR位点及分布特征，进而利用Primer5．0软件设计SSR位点上下游250bP侧翼引物。并利用PCR扩增筛选SSR多态性引物,根据SSR扩增产物的多态性，利用UPGMA方法对14份薏苡种质材料进行聚类分析以确定其亲缘关系。结果表明：在全长140745hp的薏苡叶绿体基因组DNA中，共搜寻到38个SSR位点．平均每383