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1999年,为加强实践教学环节,强化基本技能训练,提高学员分析问题和解决问题的能力,培养学员的服务意识与奉献精神,使课程总体设计和教学组织更加符合教育规律,使学员早期接触临床,充分利用医院患者资源自我学习,学校开始启动了临床医学教学改革工作,并于2001年开始陆续在临床医学、海军临床医学、麻醉医学、精神病与精神卫生本科专业实施“3+2”临床医学培养模式。