【摘 要】
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使用Codon W软件分析大头金蝇[Chrysomya megacephala(Fabricius,1794)]转录组10923条全长转录序列的密码子偏好性。结果表明,大头金蝇转录组中的AT含量(61.81%)远大于GC含量
【机 构】
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安顺学院农学院,贵州省昆虫信息系统与资源开发利用重点实验,内蒙古师范大学生命科学与技术学院
【基金项目】
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贵州省教育厅项目(编号:黔教合KY字[2014]271、黔教合人才团队字[2015]71),贵州省科技厅项目(编号:黔科合LH字[2014]7503),内蒙古高等学校科研重点项目(编号:NJZZ17041)
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使用Codon W软件分析大头金蝇[Chrysomya megacephala(Fabricius,1794)]转录组10923条全长转录序列的密码子偏好性。结果表明,大头金蝇转录组中的AT含量(61.81%)远大于GC含量(38.19%);PR2(parity rule 2,即密码子偏好性)绘图结果显示,密码子第3位碱基A的使用频率大于碱基T,碱基G的使用频率大于碱基C;中性绘图结果显示,该序列密码子的使用更多地受到选择压力的影响;有效密码子数(effective number of codons,简称
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