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运用AFLP技术,对广东鲮鱼原种场保存的鲮原种2个子群体（子群体h、q）各29个个体进行遗传多样性分析。25对AFLP引物组合中的6对引物扩增共产生173条条带,其中多态位点数为72,多态位点比例为41.5%。在6对引物产生的173条扩增条带中,有一条扩增条带在子群体h中的出现频率远远高于其在子群体q中的出现频率（72.4%〉20.6%）,编号为E2M4-1。遗传多样性分析结果表明,子群体h的遗传多样性指数高于子群体q（0.1367〉0.0998）。该研究为筛选鲮原种群体2个子群体间的特异性分子标记做了初