伪狂犬病病毒基因编码区碱基组成与密码子使用偏差

来源 :遗传学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：Fish_FF1314

【摘要】

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由于伪狂犬病病毒(PRV)中G+C含量高达74%,至今尚没有一个毒株完成全基因组测序.对已知的68个PRV基因编码区序列碱基组成及密码子使用现象进行了统计分析,结果发现PRV基因中存

【作者】

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马相如肖少波方六荣陈焕春

【机构】

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华中农业大学农业微生物学国家重点实验室,华中农业大学农业微生物学国家重点实验室

【出处】

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遗传学报

【发表日期】

：

2005年6期

【关键词】

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伪狂犬病病毒 G+C含量同义密码子相对使用度(RSCU) 偏差调节基因 pseudorabies virus (PRV) G+C content relat

【基金项目】

：

国家自然科学基金

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由于伪狂犬病病毒(PRV)中G+C含量高达74%,至今尚没有一个毒株完成全基因组测序.对已知的68个PRV基因编码区序列碱基组成及密码子使用现象进行了统计分析,结果发现PRV基因中存在非常强的密码子使用偏差.所有68个PRV基因编码区密码子第三位总的G+C含量为96.24%,其中UL48基因高达99.52%.PRV基因偏向于使用富含GC的密码子,特别是以C或G结尾的密码子.此外,还发现PRV中G+C含量变化较大的UL48、UL40、UL14和IE180等基因附近正好与已知的PRV基因组复制起始区相对应.根

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