【摘 要】
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目的 克隆细粒棘球绦虫蛋白激酶B AKT2(Echinococcus granulosus AKT2,EgAKT2)基因并分析其序列及其蛋白的生物信息. 方法 以细粒棘球蚴为对象,利用RT-PCR技术克隆获得EgAKT2
【机 构】
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新疆医科大学药学院,新疆乌鲁木齐8530054;新疆医科大学第一附属医院临床医学研究院;新疆医科大学药学院,新疆乌鲁木齐8530054;新疆医科大学第一附属医院临床医学研究院;新疆医科大学公共卫生学院
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目的 克隆细粒棘球绦虫蛋白激酶B AKT2(Echinococcus granulosus AKT2,EgAKT2)基因并分析其序列及其蛋白的生物信息. 方法 以细粒棘球蚴为对象,利用RT-PCR技术克隆获得EgAKT2基因序列并结合生物信息学方法对其蛋白质序列的跨膜区、亚细胞定位、亲水性、潜在信号肽剪切位点、ATP结合位点、磷酸化位点,及其编码蛋白的二级结构、三级结构等生物信息进行分析,并进行多序列分析和同源性比较. 结果 克隆获得EgAKT2基因序列全长为1 896 bp,编码610个氨基酸.氨基酸序列分析该基因编码蛋白为亲水性蛋白,相对分子质量为69.635 64×103,理论等电点为5.80,无信号肽序列和跨膜区;该蛋白主要定位在细胞质和细胞核,预测含有11个磷酸化位点,19个ATP结合位点,具有PKC激酶和PH结构域,二级结构以无规则卷曲为主,三级结构显示EgAKT2结构域区构成弯曲状螺旋结构.多序列比对分析,EgAKT2氨基酸序列与多房棘球绦虫的同源性为92％,进化树显示EgAKT2与人、黑猩猩的AKT2不在同一条分支. 结论 预测EgAKT2蛋白与多房棘球绦虫高度同源.该蛋白含有PKC激酶和PH结构域,可能参与调节细粒棘球绦虫能量代谢过程.
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