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细菌反硝化法是目前同时分析天然水中硝酸盐氮、氧同位素组成的最新方法。该方法包括反硝化菌的选取与培养，利用反硝化菌将硝酸根完全转化成N2O气体以及N2O气体的提取、纯化和同位素测定。该方法采用硝酸盐标准，对测试结果需进行试剂本底、同位素分馏、同位素交换校正。与传统方法相比，细菌反硝化法可同时分析低浓度微量水中硝酸盐的氮、氧同位素组成，且速度更快捷，结果更可靠。