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目的了解和比较不同采集样本对手足口病病原体的检出率,优化样本采集方案和提高检出率,为预防和控制手足口病提供准确的实验室依据。方法采用实时荧光RTPCR(定量)法对钦州市2011年~2012年采集的不同样本进行检测,并对结果进行统计分析。结果以疱疹液的检出率为98.46%64/65)最高,大便96.81%(91/94)、肛拭子94.74%(432/456)和咽拭子88.20%(142/161)检出率分列2、3、4位。而以脑脊液以8.00%(2/25)检出率最低。结论应采集患者疱疹液或大便(肛拭子),以提高手