【摘 要】
：
微卫星或简单重复序列(simple sequence repeat, SSR)在真核和原核生物以及病毒基因组中普遍存在,并被广泛用于遗传与进化研究。本研究从NCBI中下载埃博拉病毒属的四个不同种
【机 构】
：
湖南大学生物学院生物信息学中心; 中国检科院动植物检疫研究所;
【基金项目】
：
2016年中国国家重点科学研究和发展计划(2016YFD0500300和2016YFC1200200);海量跨境生物物种查验控制技术研究与应用(2017YFF0210300);海量跨境物种大数据平台及评估预警系统(2017YFF0210301)共同资助
论文部分内容阅读
微卫星或简单重复序列(simple sequence repeat, SSR)在真核和原核生物以及病毒基因组中普遍存在,并被广泛用于遗传与进化研究。本研究从NCBI中下载埃博拉病毒属的四个不同种的埃博拉病毒全基因组序列,筛选36条作为实验材料,利用IMEx在线提取软件提取SSRs,用Python编程统计数据,从而分析SSRs在埃博拉病毒全基因组序列中的分布情况。分析得出,埃博拉病毒基因组序列中二型SSRs含量最为丰富,其次是一型SSRs,三型SSRs有少量,四型SSRs则更少,没有发现五型和六型SSRs。在更深入的分析中得出在埃博拉病毒属四个种中,含A/T碱基的SSRs含量远远大于含C/G碱基的SSRs。分析得出一型SSRs中(A)n/(T)n远多于(G)n/(C)n,二型SSRs中不存在(GC/CG)n,三型中也不存在(GGC/CGG/GCG/CCG/CGC/GCC) n。上述发现可能跟埃博拉病毒的致病机理有密切联系。通过对埃博拉病毒基因组序列中SSRs的分析,为研究埃博拉病毒的变异情况及致病机制提供更多参考。
其他文献
本论文以壳聚糖为原料制备了N-琥珀酰壳聚糖和N-乳糖酰壳聚糖两种靶向载体，研究了水溶性及脂溶性抗肿瘤药物与其偶连的化学反应条件，为缓释及靶向抗肿瘤药物的制备提供初步的参
[目的]研究嫁接方法与生长调节剂协同作用对白玉芒嫁接成活率的影响,为白玉芒种苗的繁育提供理论基础。[方法]以海南本地芒一年生苗木作砧木,白玉芒一年生枝条作接穗,通过不
随着教育改革的进一步深入,各种教育形式都在社会教育领域中呈现出了蓬勃发展的势头,中职教育作为我国教育领域的主要组成部分,其在学生培养和推动教育发展上的重要性越来越
目的:研究压力管理模式在手术室护理管理中的应用效果。方法:选取在2017年1月～2018年4月医院手术室工作的护士21名,2017年1～8月为实施前,2017年9月～2018年4月为实施后,比较实施
介绍了透明氧化铁黄颜料的性质、用途、制备方法以及改性处理.通过在反应过程中和/或反应结束后加入各种助剂处理,可得到透明度高、分散性好、色相纯、耐热性能优良的透明铁
随着我国市场经济的不断发展,医药行业竞争也日趋激烈,伴随国家医改的不断深入,医药行业也面临着巨大的机遇与挑战。但是传统、落后的销售模式却制约、阻碍着我国医药企业的
<正>Kartagener综合征是一种少见的先天性遗传性疾病,又称支气管扩张-副鼻窦炎-内脏转位综合征,是原发纤毛运动障碍综合征的一种。由于遗传性缺陷致纤毛先天性减少或纤毛内缺