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生物信息学实验的实施通常需要整合多种类型的数据和工具，随着大量的web服务、算法程序和分析工具的出现，如何高效整合这些可用资源共同完成分析实验是当前生物信息学研究的重要内容之一，工作流技术已经成为解决这类问题的一种通用机制。然而，生物信息学工作流的实施涉及高通量数据的计算与存储，同时面临着资源异构性和分布性的挑战。本文首先介绍了生物信息学工作流的基本机制，然后阐述了面向生物信息学的工作流管理系统框架，最后讨论了框架应用中存在的问题和可能的解决途径。