【摘 要】
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[目的]探讨CaM和CML基因家族在兰科植物不同组织和与菌根真菌建立共生关系过程中的潜在功能。[方法]依据已发表的拟南芥CaM和CML基因家族蛋白序列,利用生物信息学方法对小兰
【机 构】
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中国林业科学研究院林业研究所、林木遗传育种国家重点实验室、国家林业局林木培育重点实验室,沈阳农业大学林学院
【基金项目】
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国家高技术研究发展计划(863计划)子课题(2013AA102607-3);北京市植物资源研究开发重点实验室开放课题(PRRD-2016-ZD1)
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[目的]探讨CaM和CML基因家族在兰科植物不同组织和与菌根真菌建立共生关系过程中的潜在功能。[方法]依据已发表的拟南芥CaM和CML基因家族蛋白序列,利用生物信息学方法对小兰屿蝴蝶兰和铁皮石斛全基因组进行搜索,通过多种生物软件或在线工具对CaM和CML基因家族蛋白序列进行筛选及确定、蛋白结构分析、系统进化分析及结构域预测;利用转录组数据绘制heatmap图,对小兰屿蝴蝶兰不同组织(花、叶、茎、根)及石斛种子与美胞胶膜菌共生条件下CaM和CML基因家族的表达情况进行分析。[结果]在小兰屿蝴蝶兰和铁皮石斛全
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