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期刊论文
基于正则表达式的生物序列检索方法
基于正则表达式的生物序列检索方法
来源 :莆田学院学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xubin761
【摘 要】
:
提出利用正则表达式进行生物序列检索时应先确定该正则表达式的最优NFA,然后再转化为相应的算法步骤,进而提高生物序列的检索效率。并给出了一个具体的序列检索实例。
【作 者】
:
郑珂晖
宁正元
王健
【机 构】
:
福建农林大学计算机与信息学院,福建师范大学地理科学学院
【出 处】
:
莆田学院学报
【发表日期】
:
2009年5期
【关键词】
:
正则表达式
序列检索
模式匹配
regular expression sequence indexing pattern matching
【基金项目】
:
基金项目:福建农林大学校内青年基金(021749),福建省自然科学基金资助项目(2006J0018)
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提出利用正则表达式进行生物序列检索时应先确定该正则表达式的最优NFA,然后再转化为相应的算法步骤,进而提高生物序列的检索效率。并给出了一个具体的序列检索实例。
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