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采用形态学标记和RAPD分子标记,对9份观赏辣椒种质资源进行了遗传多样性研究,结果表明,植株高度、株型、叶色、果长、果形指数、果实着生方式等形态指标适合观赏辣椒植物学性状观察记载;供试材料中RAPD分子标记多态位点多,有效等位基因频率高,适合观赏辣椒种质资源的区分与鉴定。两种方法对物种进行区分和鉴定都是切实可行的,准确率与标记选用的种类和数量有关。