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后期教学是本科教学的重要阶段，由于种种因素的影响和冲击，地方医学院校这一阶段的教学工作长期存在着困扰。本文通过对济宁医学院2015届临床医学、药学等10个专业652名应届毕业生和41名主讲教师、实习带教教师、教学管理人员、辅导员等，进行了问卷调查和深度访谈，剖析了困扰的表现、困扰的危害和困扰的共性因素，提出了深化考研制度改革、制定积极毕业生就业政策，树立科学人才观、转变用人观念，主动适应考研需求、深化教学改革，积极探索新型教学方法、努力提高学生学习兴趣，提高自律意识、养成良好习惯等化解策略和对策建议。