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为调查新疆小海子垦区牛梨形虫感染情况,采用PCR对垦区9个采样点共568份牛全血样本进行检测,扩增牛梨形虫18SrRNA基因部分序列并测序,经比对确定虫种,构建系统发育树.结果显示,共检测出44份阳性样品,总阳性率为7.75%,其中45团的牛感染率较高,约14.58%,叶城牧场与53团的牛感染率较低,均在5%以下,46团的牛未发现梨形虫.在44份阳性样品中,发现42份环形泰勒虫(Theileria annulata),2份感染东方泰勒虫(T.orientalis),未发现巴贝斯虫感染.此次对于新疆小海子垦区牛梨形虫的感染情况和感染虫种进行了调查,提供了一线数据,为小海子垦区牛梨形虫病的综合防控提供了技术支撑.