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北京大学生命科学学院林忠平教授在植物基因工程研究中，注重生物技术应用的安全问题。他认为，生物技术的利用，要有利于生物多样性的保护，只有保护基因资源的多样性，才能保护生态环境。保护生态环境是植物生物技术的重要课题。林忠平教授领导的农业分子生物学实验室，在植物对逆境胁迫的抗性基因工程、植物生物反应器生产药用蛋白、植物次生代谢的基因调控、转基因食品的致敏性评估等方面，研究取得了诸多成果，其中一些成果具重要和潜在的应用价值。