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构建长白山药用真菌鸡爪苓菌丝体和子实体cDNA文库并测序，发掘鸡爪苓菌丝体和子实体发育中差异表达的基因；通过同源性比对，分析与陕西猪苓的亲缘关系，确立长白山鸡爪苓的分类地位。结果表明：鸡爪苓菌丝体和子实体cDNA文库滴度分别为1．504×10^10 pfu／mL和1．094×10^10 pfu／mL。从菌丝体cDNA文库选取500个克隆，经测序获得452个高质量表达序列标签（EST），序列拼接出的单一基因簇包含310个单一基因；从子实体cDNA文库中选取的500个克隆，经测序获得472