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内蒙古中部地槽褶皱系(Ⅰ)苏尼特右旗晚华力西地槽褶皱带(Ⅱ),宝音图台隆(Ⅲ)中段,苏吉音花复背斜(Ⅳ)南翼,矿体赋存于早二叠世花岗闪长岩内,主要受北北西和北东向断裂构造带控制.钼矿化围岩蚀变包括硅化、绢云母化、绢英岩化等.根据查干花钼矿成矿地质特征,矿床成因属印支期岩浆热液型.区域内石英—钾长石化、石英—绢云母化、石英—孔雀石化等面状蚀变晕是重点找矿标志,为今后同类型区域地质找矿及成矿规律研究提供了资料依据.