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《统筹推进世界一流大学和一流学科建设总体方案》从管理制度和保障机制等方面为“双一流”建设提供了可能性，但纵观我国目前高校治理体系现状，在如何处理好政府与大学的关系完善内部治理结构、如何借鉴欧美一流大学的办学经验、推进现代大学制度建设、创建世界一流大学等方面仍然存在诸多难题。因此，实施建设与改革并重的“双一流”建设，必须从一流的高校治理理念、一流的内部治理结构、一流的管理者入手推进“双一流”建设。