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目的测定慢性乙型肝炎病毒(HBV)感染者HBVDNA全序列,分析S区基因缺失模式、频率及相关因素。方法慢性HBV感染者59例,其中HBV携带7例,慢性肝炎31例,肝硬化10例,重型肝炎6例,原发性肝癌5例。结果25.4%(15/59)慢性HBV感染者有S区基因缺失,未发现S基因缺失。Pre-S基因缺失均见于C基因型患者。Pre-S基因缺失患者中,20%(3/15)HBsAg、抗HBs共存,与无s区缺失者比较有明显差异(P〈0.05)。PreS基因缺失与病程(偏相关系数0.28,P=0.049)、抗病毒治疗