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基于虚拟企业开放性、非线性、涨落性和非平衡性的特质，本文借鉴普里高津“功能一涨落一结构”三角循环转化关系，提出了虚拟企业的自组织管理模式，探讨了虚拟企业自组织的控制过程并构建了复杂虚拟企业控制模型，深入挖掘了虚拟企业通过自组织形式进行生产服务或运营管理的机理。通过分析自组织对虚拟企业运作的内在影响，揭示了虚拟企业自组织的演化机理。