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随着三部委深化医药卫生体制改革的部署和要求,我国启动了按病种收费方式的改革试点工作。按病种收费对规范诊疗行为和控制医药费用的不合理增长起到了积极作用。由于按病种收费颠覆了传统按项目收费的模式,医疗机构实际工作中遇到了一系列问题,如现行的医院会计制度并未规范病种收入的确认及其财务分类、患者如何实现医保结算等。本文拟探讨按病种收费模式下在财务、医保等方面遇到的困难与建议。