【摘 要】
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目的了解2010—2012年广州地区发热呼吸道感染患者的人冠状病毒各亚型分子进化情况。方法采用RT-PCR法扩增HCoV-OC43、HCoV-229E和HCoV-NL63阳性标本的NP、RdRp和S基因部分片段，构建载体后进行测序，利用Bio-edit、Mega4.0、Clustal1.83等生物信息学软件对测序成功的基因序列进行比对和分析，建立HCoV-OC43、HCoV-229E和HCoV-N
【机 构】
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510080 广州，中山大学热带病防治研究教育部重点实验室，中山大学香港大学粤港传染病监测联合实验室,510080 广州，中山大学附属第一医院呼吸科ICU室,511436 广州，广州医科大学基础学院病
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目的了解2010—2012年广州地区发热呼吸道感染患者的人冠状病毒各亚型分子进化情况。
方法采用RT-PCR法扩增HCoV-OC43、HCoV-229E和HCoV-NL63阳性标本的NP、RdRp和S基因部分片段，构建载体后进行测序，利用Bio-edit、Mega4.0、Clustal1.83等生物信息学软件对测序成功的基因序列进行比对和分析，建立HCoV-OC43、HCoV-229E和HCoV-NL63不同基因区域的分子进化树。
结果2010—2012年期间，HCoV-OC43、HCoV-229E和HCoV-NL63亚型在广州均未检测到重大变异株或重组株。HCoV-OC43与Belgium和中国香港来源流行株亲缘关系较近(GenBank登录号JN129834和AY903460)；HCoV-229E与Amsterdam来源的病毒株亲缘关系最近(GenBank登录号JX503060)；HCoV-NL63与中国北京和Amsterdam来源的流行株亲缘关系较近(GenBank登录号JX104161和DQ445911)。各亚型NP和RDRp为保守基因，S基因变异较大。
结论2010—2012年期间，广州至少存在3种HCoV-OC43、HCoV-229E和HCoV-NL63流行株，没有发现重大变异株或重组株。各亚型NP和RDRp均为保守基因，可用于病毒的检测，S基因变异较大，适用于对分子变异规律的研究。
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