目的分析柴胡疏肝散加减治疗功能性消化不良的临床疗效。方法选择2016年7月—2017年7月我院收治的100例功能性消化不良者为研究对象,依照就诊顺序,将病患分为观察组以及对照组,每组50例。对照组使用吗丁啉片+氢氧化铝凝胶治疗。观察组使用柴胡疏肝散加减治疗。分析疗效以及前后中医主要症状以及次要症状积分。结果对照组患者治疗有效率为74.00%,观察组为98.00%。和对照组相比,观察组治疗效果明显更好,P<0.05。治疗前,2组病患的主要以及次要临床症状积分无明显差异,P>0.05;治疗后,和对照组相比,观察组的大便不畅、嗳气、食欲不佳、善太息、两胁胀满、胃脘胀痛情况明显更好,P<0.05。结论对于功能性消化不良者,使用柴胡疏肝散治疗,安全性强,不良反应少,疗效好,可消除病患中医症状积分,值得进一步使用。