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针对智能交通系统中的大数据分布式存储过程中分布均衡度较低、安全性差等问题,提出面向智能交通系统的大数据分布式存储算法.利用云存储架构构建大数据分布式存储模型及三层数据存储层次,通过上层的数据高度访问、中层数据连接以及下层的数据归档,依据设定的已知数据粒度、机率以及弹性,计算数据存储强度以及层次,实现大数据存储.通过超混沌算法重排编码,并通过非线性向量量化方法实现大数据同态融合加密,构建加密、解密密钥,完成已存储大数据加密防护.经实验验证,上述算法存储过程中分布均衡度较高、负载均衡性较低;读/写数据的时间低,大数据分布式存储性能稳定;数据加密抗攻击性较高,能够实时加密防护存储大数据.