Rapid Amplification of Flanking Sequences of a Known DNA Region by Partial Restriction Digestion and

来源 :中国农业科学(英文版) | 被引量 : 0次 | 上传用户:shall202
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A simple and efficient method for cloning the flanking genomic sequences of a known DNA region is reported in this study. This method combined partial restriction endonuclease digestion, adaptor ligation, and a single round polymerase chain reaction. Total genomic DNA was partially digested with the frequent-cutting restriction enzyme Mse Ⅰ. The partially digested products were ligated to an unphosphorylated adaptor. A hot start PCR amplification with Taq polymerase and dNTP was performed with a DNA-specific primer and the adaptor primer complementary to the adaptor and the Mse Ⅰ recognition site. The amplified products were fractionated, cloned and sequenced. By this method, we cloned the downstream region of a gynoecious marker TG/CAC234 from cucumber (Cucumis sativus L.).
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