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用EeoRⅤ、MboⅡ、NaeⅠ、PvuⅡ、StyⅠ、Kpn Ⅰ、SacⅠ、Hind Ⅲ、DraⅠ、HpaⅡ等10种限制性核酸内切酶对星洲银罗非鱼线粒体DNA（mtDNA）进行酶切分析，其中StyⅠ、SacⅠ和DraⅠ表现出多态性，HpaⅡ酶切后产生零碎片段，EcoRⅤ、NaeⅠ、PvuⅡ、Kpn Ⅰ只有一个切点，HindⅢ有两个切点，MboⅡ有5个切点但有小片段丢失。在星洲银罗非鱼中共发现4种单倍型，单倍型间平均遗传距离为0．0080，其mtDNA多态度为0．0024，遗传多样性较丰富。