了解北京市疱疹性咽峡炎的流行情况及病原体构成，为该病的预防与控制提供参考。

收集2016年北京市15个区监测医院中首次就诊的10岁以下疱疹性咽峡炎和手足口病病例基本信息及临床表现，并采集咽拭子进行病原体检测。

本研究共纳入符合条件的疱疹性咽峡炎病例744例，其中5岁及以下病例占86.83%，性别比（男：女）为1.23: 1；手足口病病例1 935例，5岁及以下病例占88.94%，性别比为1.40: 1。两类病例的标本采集高峰都集中在5—7月。疱疹性咽峡炎的发病至诊断时间间隔为（1.08±1.32）d，手足口病的发病至诊断时间间隔为（1.12±1.33 ）d，差异无统计学意义（t= 0.614，P= 0.336）。疱疹性咽峡炎和手足口病病例中发^{热的比例分别为67.20％和45.94% （}x²= 96.158，P < 0.001 ）。诊断为疱疹性咽峡炎的病例全部为轻症，而手足口病病例有21例（1.09%）发展为重症。肠道病毒核酸阳性病例分别为401例（53.90%）^{和1 362例（70.39%)（}x²= 64.640，P < 0.001 ）。疱疹性咽峡炎的病原体主要为其他肠道病毒（62.59%），而手足口病的病原体主要为CA16 （44.93%）。

疱疹性咽峡炎与手足口病发病人群近似，均为5岁以下的儿童，男性略高于女性，发病高峰均为5—7月。引起两者发病的病原体构成不同，临床症状也有所区别，疱疹性咽峡炎的预后较好。EV71、CA16、CA6和其他肠道病毒等都可引起疱疹性咽峡炎和手足口病，所以应重视疱疹性咽峡炎，并参考手足口病进行病例隔离和环境消毒。