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穆龙套金矿床位于中亚成矿域南天山成矿域西段、卡拉库姆和中哈萨克斯坦-北天山板块的碰撞带上,赋矿围岩为寒武—奥陶纪别索潘组,金矿成矿时代主要为二叠纪.通过研究穆龙套金矿床区域构造演化及构造、岩浆控矿作用,提出穆龙套金矿床控矿因素为NWW向桑格龙套-塔姆德套剪切带及NE向穆龙套-道古兹套剪切带,岩浆活动与成矿密切相关.中亚成矿域新疆境内穆龙套式金矿找矿方向是NWW向与NE向构造的交汇处及附近同成矿期隐伏或出露的花岗质岩浆岩.