基于残基接触数的蛋白质折叠速率预测

来源 :西安工业大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:guanxing1
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文中从蛋白质的三级结构出发,对数据集中二态和多态蛋白质的接触数进行筛选分类,建立了一个利用蛋白质残基接触数来预测蛋白质折叠速率的线性回归模型.模型计算预测的折叠速率和实验验证的折叠速率的相关系数以Ca原子为特征时达到了0.832,以N原子为特征时达到了0.903.结果表明残基间的相互作用对蛋白质折叠速率有很大的影响;蛋白质残基中的N原子与其他原子的相互作用对折叠速率的影响要大于残基中G原子对折叠速率的影响.
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