拓扑树间的通经拓扑距离

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给出了一种新的系统树间的拓扑距离.使用NJ、MP、UPGMA等3种方法对13种动物的线粒体中14个基因(含组合的)DNA序列数据进行系统树的构建.利用分割拓扑距离和本文给出的通经拓扑距离对这14种系统树之间及其与真树进行比较.结果显示,NJ法对获得已知树的有效率最高,MP法次之,UPGMA法最低.这14种DNA序列所构建的系统树与已知树的拓扑距离基本上是随其DNA序列长度增加而减小,但两者的相关系数并未达到显著水平.分割拓扑距离在总体上可反映树间的拓扑结构差异,但其测度精确度比通经拓扑距离要低.
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