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针对多目标约束柔性作业车间问题,提出基于混合变异算子的NSGA-Ⅱ(Non-dominated Sorted Genetic Algorithm-Ⅱ)算法。针对NSGA-Ⅱ易早熟收敛不足的问题,分别引入泊松、平均以及高斯算子来提高算法前中后期的全局以及局部寻优能力。采用模糊层次分析—改进的熵权法(FAHP-IEVM)主客观相结合的决策方法,从多组最优解集中筛选出最优方案。通过ZDT系列测试函数对改进的算法进行测试分析对比,结果表明改进算法的收敛性和多样性指标都有明显提高。最后通过算例仿真对比分析验证