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喀拉通克铜镍硫化物矿床产于侵位于准噶尔褶皱系的中基性岩体群中,下石炭统南明水组是这些岩体的直接围岩,岩体群呈带状沿NW向断裂带分布,主要岩体分异良好,由上至下可划分为:黑云母石英闪长岩相、黑云母石英角闪辉长岩相、黑云母角闪苏长岩相和黑云母角闪橄榄苏长岩相;各岩相之间均呈渐变过渡关系,矿体均赋存于中基性岩体的橄榄苏长岩相、苏长岩相和橄榄辉绿辉长岩中,矿体形态与岩体基本一致,反映出本区铜镍矿体均受中基性岩体控制.这些含矿岩体具有“三高一低”的地球物理特征.矿床的硫同位素、铅同位素、锶同位素和稀土元素特征表明:这些岩体群具有明显的亲缘性,它们和成矿物质均来源于地幔的玄武岩浆.最后,根据这些特征指出了找矿方向.