近年来,国内外经济学文献已日益重视对我国企业数据的实证运用,然而,通过对现有主要企业数据来源的分析发现,现有企业数据普遍存在样本信息时效性不强、抽样缺乏随机性和指标多元性不足等质量缺陷,这或对实证研究结论的准确性、科学性和政策指导价值产生一定影响。为此,在广东开展的2015年中国制造业企业-员工匹配调查(CEES),与现有数据相比,本次调查在样本信息时效性、抽样随机性和指标多元性等方面均做出了较大的质量改进。运用上述调查数据,本文选取企业家创新精神与企业经营绩效、出口企业的"生产率悖论"、信贷约束与企业经营绩效等三大研究热点领域为例,首次从实证角度验证了企业数据质量缺陷对研究结论偏差的实际影响。结果发现:现有企业数据样本信息缺乏时效性,影响了研究结论对于当前中国经济真实状况的准确判断;抽样缺乏随机性,影响了研究结论对于中国企业总体状况的科学推断;指标多元性不足,造成了实证研究对企业部分经济行为的测度存在统计定义误差,对研究结论的精度造成一定影响。