为了解我国甘肃省、陕西省流行的人副流感病毒3型(Human parainfluenza viruse-3,HPIV-3)的基因特征和流行规律,2009～2011年从上述两省急性呼吸道感染患者中共采集咽拭子标本719份,采用多重反转录聚合酶链反应(Multiplex reverse transcription polymerase chain reaction,多重RT-PCR)方法对常见呼吸道病毒性病原体进行筛查,HPIV-3阳性标本再用巢式PCR(nested polymerase chain reaction,nested PCR)扩增其血凝素-神经氨酶蛋白(Hemagglutinin-neuraminidase,HN)基因,进行序列测定和基因分析。共获得13株HPIV-3HN基因序列,均属于C3亚群,核苷酸差异和氨基酸差异分别为0.2%～2.3%和0～1.1%。与美国、加拿大和澳大利亚的HPIV-3的HN基因序列之间的核苷酸差异和氨基酸差异较大,最大分别为6.0%和3.4%。shaanxi09-2与shaanxi10-H0091、shaanxi10-H0055与gansu11-62110372和shaanxi09-2与BJ/291/09之间存在核苷酸差异分别为0.9%、0.5%和0.6%,但均无氨基酸差异。提示甘肃和陕西两省在不同年份之间存在HPIV-3的持续循环传播。引起2009～2011年甘肃和陕西两省HPIV-3流行的毒株属C3亚群。