【摘 要】
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为深入开发非洲菊SSR分子标记,进而推动非洲菊遗传多样性研究,以云南红非洲菊的转录组序列为基础,对SSR位点进行挖掘。结果表明:通过MISA软件从60563条unigenes检测出14928个
【机 构】
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三明市农业科学研究院,三明市林木种苗站,厦门市农业技术推广中心
【基金项目】
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三明市林业科学研究项目(明林计财〔2017〕49号),福建省科技计划星火项目(2018S0031),2019年度中央引导地方科技发展专项资金项目(2019L3025)
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为深入开发非洲菊SSR分子标记,进而推动非洲菊遗传多样性研究,以云南红非洲菊的转录组序列为基础,对SSR位点进行挖掘。结果表明:通过MISA软件从60563条unigenes检测出14928个SSR位点,分布于11932条unigenes中,出现频率为24.65%,平均分布距离为3.43 kb。优势重复基序为单核苷酸、二核苷酸和三核苷酸,分别占总SSR位点的63.44%、21.54%和14.06%。14928个SSR位点由73种重复基序构成,(A/T)、(AG/CT、AC/GT)、(AAT/ATT、AAG
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