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并行交替采样技术可以有效解决单片模数转换器（analog—to—digitalconverter，ADC）转换速率与量化精度间的矛盾，但是多通道间的失配误差将严重降低系统性能。提出了一种基于子空间投影技术的系统误差估计方法，利用多通道时延对应的频域线性相位矢量与噪声子空间的正交特性实现增益误差以及时基误差的精确估计。该方法迭代次数少，估计精度较高，对噪声以及偏置误差稳健，并且可以同时完成信号重构。仿真数据的处理结果验证了该方法的有效性。