【摘 要】
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目的 使用集成数据分析方法识别胰腺癌中的关键eRNA,并探讨其在胰腺癌预后及发生发展中的作用.方法 首先使用PreSTIGE预测组织特异性增强子RNA的调控基因,构建eRNA-靶标对.用探索癌症lncRNA功能的交互式开放平台TANRIC研究来自癌症和肿瘤基因图谱(The cancer genome atlas,TCGA)的胰腺癌转录组数据和临床数据.结果 确定了147个关键eRNA,其中与胰腺癌整体存活率最相关的eRNA是LINC00242(Kaplan-Meier对数秩检验,P0.4,P0.4,P<0
【机 构】
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重庆市合川区人民医院,重庆 合川 401520;遵义医科大学附属医院 针灸科,贵州 遵义 563099
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目的 使用集成数据分析方法识别胰腺癌中的关键eRNA,并探讨其在胰腺癌预后及发生发展中的作用.方法 首先使用PreSTIGE预测组织特异性增强子RNA的调控基因,构建eRNA-靶标对.用探索癌症lncRNA功能的交互式开放平台TANRIC研究来自癌症和肿瘤基因图谱(The cancer genome atlas,TCGA)的胰腺癌转录组数据和临床数据.结果 确定了147个关键eRNA,其中与胰腺癌整体存活率最相关的eRNA是LINC00242(Kaplan-Meier对数秩检验,P0.4,P0.4,P<0.001),LINC00242主要通过突触信号转导等生物学过程及PI3K-Akt、MAPK等信号通路影响胰腺癌的发生发展(校正后的P<0.05).结论 LINC00242可能是胰腺癌中关键的预后相关eRNA,对临床结局具有积极影响,可预测胰腺癌的预后并作为其潜在的治疗靶标.
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