苹果三倍体杂种后代基因组DNA甲基化水平和模式的MSAP分析

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为了明确苹果三倍体杂种后代中基因组DNA甲基化水平及模式的变化特征,本文以‘金冠’ב四倍体嘎拉’苹果的61份三倍体后代为试验材料,采用MSAP分子标记技术对其进行了分析。结果表明:(1)61份三倍体杂种后代的总甲基化率在10.74%~28.86%之间,全甲基化率在7.87%~24.22%之间,半甲基化率在2.10%~11.84%之间。与母本相比,总甲基化和全甲基化呈上升趋势,半甲基化呈下降趋势;与父本相比,均呈下降趋势。(2)在苹果三倍体杂种的基因组加倍和重组过程中,发生了大量过或超甲基化和去甲基化变异,少量发生了次甲基化现象,极少部分的甲基化状态介于双亲之间。(3)共获得4条DNA甲基化差异片段,有3条能够在苹果基因组中检测到,且同源性较高,分别位于第1条和第12条染色体的叠连群上,但是具体功能没有描述。研究结果表明,苹果三倍体杂种后代的DNA甲基化水平与倍性相关性不大,在其形成过程中发生了大量的过或超甲基化变异,为苹果三倍体育种中表观遗传变异的研究提供了依据。 In order to clarify the variation characteristics of genomic DNA methylation level and pattern in the offspring of apple triploid hybrids, 61 triploid offspring of ’Golden Delicious’ × ’Tetraploid Gala’ apple were used as experimental materials and MSAP molecular markers Technology has analyzed it. The results showed that: (1) The total methylation rates of 61 triploid hybrids ranged from 10.74% to 28.86%, the full methylation rates ranged from 7.87% to 24.22%, the half methylation rates ranged from 2.10% ~ 11.84% between. Compared with the female parent, the total methylation and the full methylation showed an upward trend, the half-methylation showed a downward trend, compared with the male parent, all showed a downward trend. (2) During the genome doubling and recombination of apple triploid hybrids, a large number of hypermethylation and demethylation occurred, a small amount of methylation occurred, and a few methylation status Between parents. (3) A total of four DNA methylation differential fragments were obtained, of which three were detected in the apple genome and were highly homologous to the contigs of chromosomes 1 and 12, respectively Function is not described. The results showed that the DNA methylation level of triploid hybrids was not significantly correlated with ploidy. A large number of over-or hypermethylated mutations occurred during the formation of the diploid in apples. Genetic variation provides the basis for the study.
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