茶翅蝽非典型气味受体基因的克隆及其生物信息学特征和组织特异性表达分析

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为明确茶翅蝽Halyyomorpha halys的非典型气味受体(odorant receptor co-receptor,Orco)基因的生物信息学特征和组织特异性表达谱,采用Trizol法提取茶翅蝽成虫触角的总RNA,利用RT-PCR技术克隆其Orco基因,使用生物信息学软件对茶翅蝽Orco蛋白进行跨膜区域预测、结构分析和系统发育分析,并采用实时荧光定量PCR技术测定Orco的组织表达谱.结果表明,克隆获得茶翅蝽Orco基因并命名为HhalOrco,该基因的开放阅读框全长1 428 bp,编码475个氨基酸.Hha-1Orco蛋白的二级结构中,α螺旋占34.11%,无规则卷曲占36.84%,延伸链占29.05%;其分子质量为53.49 kD,等电点为6.16,无信号肽,是非分泌蛋白;有7个跨膜区,是疏水性蛋白,疏水性系数的平均值为0.297;预测的HhalOrco蛋白为对称亚基构成的同源四聚体.系统进化分析发现,HhalOrco与同为半翅目的荔蝽Tessaratoma papillosa亲缘关系最近.qPCR检测结果显示,HhalOrco基因主要在雌雄成虫的触角中表达,在成虫的头、胸、腹、足中仅有微量表达.
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