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本试验旨在阐明牦牛源志贺菌致病性及分子流行特性,为探索志贺菌流行途径,制定合理的防控策略提供新思路.2017年在甘肃、青海、西藏三省(区)共采集牦牛肛门棉拭子样品1 396份,通过选择培养基筛选、生化鉴定、血清凝集试验对分离菌株进行系统鉴定,应用PCR方法检测分离株中ipaH、ipaBCD、ial、sen、set1A、set1B和stx七种毒力基因流行情况.参照McMLST网站数据库提供的15对管家基因序列进行MLST分型;并参考美国CDC的PulseNet实验方法,用限制性内切酶NotⅠ和XbaⅠ分别对福氏志贺菌和宋内志贺菌染色体进行酶切,对这些分离菌株进行PFGE分析.结果 显示,41株分离株符合志贺菌生化特征,分为4个生化表型,B3 (36.59％)和B4(32.35％)为主要生化表型.血清凝集试验鉴定23株为福氏志贺菌,包括四个血清型1a(n=2)、2a(n=16)、2b(n=3)、Xv(n=2);18株为宋内志贺菌,分为Ⅰ相(n=12)和Ⅱ相(n=6).共检测到6种毒力基因ipaH、ipaBCD、ial、sen、set1A、set1B,携带率分别为100％、92.68、73.17、70.73％、26.83、26.83％.具有7种毒力基因型,其中VT5和VT7型为主要流行型,分别占43.9％和24.39％,同时携带两种及以上毒力基因的志贺菌占92.68％.41株志贺菌共分为10个ST型,其中ST100、ST116、ST155型为主要流行型.NotⅠ酶切的福氏志贺菌分为13个PT型,而XbaⅠ酶切的宋内志贺菌分为14个PT型.综上所述,牦牛源志贺菌生化表型、血清型、ST型和PT既存在多态性,又有优势流行型.本试验分离的志贺菌与人源志贺菌携带相同的毒力基因,其中ipaH、ipaBCD、ial、sen基因携带率较高,对公共安全具有潜在的威胁.