猪繁殖与呼吸综合征病毒流行株Jiangxi-3的全基因组序列分析

来源 :上海交通大学学报：农业科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户：xiongxiaoxue

【摘要】

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通过RT-PCR分段扩增PRRSV流行株Jiangxi-3的基因组,参照VR2332序列,根据各片段之间相重叠的区域,将扩增片段的序列依次拼接获得Jiangxi-3完整的全基因组,并通过DNAStar软件对

【作者】

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王旭荣张彩勤赵炳武张春红杨增岐宋长绪

【机构】

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广东省农科院兽医研究所,中国农科院兰州畜牧与兽药研究所,西北农林科技大学动物医学院,内蒙古农业大学动物科学与医学学院

【出处】

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上海交通大学学报：农业科学版

【发表日期】

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2009年2期

【关键词】

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猪繁殖与呼吸综合征病毒 Jiangxi-3 全基因组序列分析 PRRSV Jiangxi-3 isolate Nsp2 whole-genome s

【基金项目】

：

国家食品安全重大专项（2001BA804A31）,广东省农业科技攻关（2003B21404、20052490100和2006B20301013）：广东省自然科学基金（04002083）,广东省自然基金重点项目（06105311）

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通过RT-PCR分段扩增PRRSV流行株Jiangxi-3的基因组,参照VR2332序列,根据各片段之间相重叠的区域,将扩增片段的序列依次拼接获得Jiangxi-3完整的全基因组,并通过DNAStar软件对其进行分析。结果表明：Jiangxi-3的Nsp2推导氨基酸发生30个氨基酸的不连续缺失,与HB-1（sh）/2002相比,Nsp2推导的第480位氨基酸由D突变为E,缺失的位置为第481位氨基酸和532～560位氨基酸;Jiangxi-3与2006年Tian Kegong等从江西“高热病”病死猪体内分

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