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为了研究吐鲁番地区古遗址分布特征，运用GIS的空间分析方法对吐鲁番地区不同时期古遗址的空间分布特征进行了分析研究。从地形特征进行分析发现吐鲁番地区古遗址在海拔-100m-200m，坡度0—15度的洪积平原区集中分布。通过点线分析发现吐鲁番地区古遗址距河流，距道路距离都在一定的范围之内分布，可以得出古遗址的分布有线性分布的特征；通过聚集分析，发现吐鲁番地区古遗址具有以交河古城和高昌故城两个比较明显的聚集点为中心分布的聚集特性。研究古遗址的空间分布特征为古遗址的进一步的研究和保护提供重要参考依据。