冠心病与生物钟关联靶基因的生物信息学挖掘

来源 :医学研究与教育 | 被引量 : 0次 | 上传用户：jinzhan2090

【摘要】

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目的分析生物节律紊乱与冠心病发生关联的潜在分子机制。方法从GEO数据库中获取GSE71226芯片数据,用R软件筛选冠心病差异表达基因;经文本挖掘和蛋白互作分析获得生物钟相关基

【作者】

：

王文栋苏翰博樊茜茜李喜龙常晓彤

【机构】

：

河北北方学院医学检验学院

【出处】

：

医学研究与教育

【发表日期】

：

2020年5期

【关键词】

：

生物钟冠心病生物信息学染色体定位富集分析 biological clockcoronary heart diseasebioinformaticschr

【基金项目】

：

河北省高等学校科学技术研究项目(Z018032),河北省卫生计生委医学科学研究课题计划项目(20180811),河北省高等学校科学技术研究重点项目(ZD2018076),河北北方学院创新人才培育项目(CXRC1316),河北北方学院大学生创新创业训练计划项目(xj201945)

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目的分析生物节律紊乱与冠心病发生关联的潜在分子机制。方法从GEO数据库中获取GSE71226芯片数据,用R软件筛选冠心病差异表达基因;经文本挖掘和蛋白互作分析获得生物钟相关基因,进行功能注释、染色体定位和互作分析。结果获得488个冠心病差异表达基因(coronary heart disease differentially expressed genes,CHD-DEGs)和64个生物钟相关基因(biological clock related genes,BRGs),在染色体上分布密集,且多与转录调控、

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