尽管社区学院以其低廉的学费及较低的入学门槛在美国高等教育大众化，特别是为弱势群体提供高等教育机会发挥着重要作用，但随着美国人口结构的变化，社区学院发展中面临的一些问题日益凸显，这表现在其较高的辍学率及较低的学生毕业率上，就业准备不充分，不能满足就业市场需要，在中等教育、社区学院及本科教育机构间的过渡和衔接不畅等方面。此外，受人口结构变化及生源减少等影响，社区学院在办学过程中还面临经费缩减、招生困难等问题。
　　毕业率低
　　毕业率低、辍学率高一直是美国社区学院发展面临的严峻问题。社区学院承担了美国45%接受高等教育学习的学生，但根据2013年6月最新数据统计，两年制社区学院的毕业率仅为24%，3年内取得副学士学位的比例为29%，从其学生转学的职能来看，社区学院学生在6年内取得学士学位的比例仅为56% 。而这一比例在少数民族中更高，非全日制学生比全日制学生更容易辍学。
　　造成这一现状的原因在于：其一，从学生的角度来说，学生基础素质不达标、知识储备不够。由于社区学院的开放入学条件，任何人皆可申请，导致很多入学者存在以下情况：仅获得高中同等学历者，四年制大学落榜者，已经远离教育很长时间的在职人员。在他们进入社区学院之初，需要学习一些相关的没有学分的补偿课程。以纽约城市社区学院为例，74%的学生要学习补偿课，32%的学生数学能力不合格，36%写作能力不过关，18%的学生阅读能力不达标。其二，客观上，学习时间不足，精力不够。大量非全日制学生都背负着一定的经济负担，超过一半的学生来自家庭年收入低于2万美元的贫困家庭。很多学生是家庭中第一代上大学的，3/10的学生每周至少要工作20个小时。
　　经费缩减
　　近年来，由于经济危机等各种原因，社区学院一直面临经费短缺问题。美国联邦政府和州政府实行基于绩效的拨款模式（performance-based funding initiative），使得很多社区学院的教育经费日益匮乏。如，2008年奥巴马的经济刺激计划（stimulus plan）拨出120亿美元作为培训经费，而后国会在审批过程中减少了20亿美元；2011年秋天，奥巴马的就业计划中批准50亿美元用于修缮更新社区学院，而实际到位资金大幅减少。以纽约城市社区学院为例，2000~2009年间，来自联邦政府和州政府的公共财政拨款降低了6个百分点，这造成社区学院生均经费支出一直较低，如图7所示，1999~2009年，社区学院生均经费支出仅增加了1美元，在各种类型教育中都是最低的。
　　在教育体系中地位降低
　　从整个教育体系的角度来说，社区学院发展面临的一个核心问题是其正变得日益分化、在高等教育中处于一种不公平的位置，这主要是由要求其用最少的成本满足教育需求最迫切人口的定位引起的，表现在社区学院越来越注重满足来自低收入或少数民族家庭学生的需求。这一方面导致高等教育体系的分野和不平等，另一方面也导致了社会阶层的分化。具体来说，如图8所示，社区学院所招收学生的社会经济地位和收入水平呈日趋下降趋势，1982年，社区学院招收的社会经济地位较高人口数占总人口的24%，而到2006年，这一比例下降到16%；相反，最贫穷、也就是社会经济地位最低学生群体在总学生中所占比例却从21%增长到28%。
　　此外，社区学院学生的民族构成也呈现同样趋势。1994～2006年，白色人口在社区学院学生中所占比例从73%下降到58%，而黑色和黄色人口却从21%增长到33%。相反，在四年制大学中，学生种族的变化却没有这么大，如在同一时期，白色人口在四年制大学中所占比例从78%下降到75%，而黑色和黄色人口却从11%提高到12%。这表明，社区学院正日益成为低收入家庭学生的选择。这不仅造成了社区学院在整个高等教育体系中的分化，而且不利于促进学生社会经济地位的提升，对于重塑美国中产阶层的美国梦非常不利。