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转录组是细胞或组织内全部的RNA转录本,可以从整体水平上反映细胞中所有基因的表达情况及其调控规律,揭示细胞和组织中的分子构成。转录组测序（RNA-Seq）技术是对转录组进行深度测序的技术。利用RNA-Seq技术对机体免疫相关基因进行筛选,可为进一步研究宿主对抗病原提供新的思路。本文主要对RNA-Seq技术、RNA-Seq测序平台的原理及特点以及RNA-Seq技术在筛选免疫相关基因中的应用做一概述。