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从项目管理角度研究政产学研协作数据库的知识产权保护机制，基于数据库项目管理五阶段论提出适用于政产学研数据库的知识产权管理模型，并以上海材料基因组数据库项目为例，详细阐述项目启动阶段的数据库知识产权战略部署、项目计划阶段的数据库知识产权计划设置、项目实施阶段的数据库知识产权保护措施、项目监测阶段的知识产权管理、项目完成阶段的知识产权运用，形成一套系统化、全方位的政产学研数据库项目的知识产权保护体制。