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多倍体化后经常出现一些新的表型；但是，大量的表型变异发生的原因一直不清楚。最近人们对拟南芥菜、棉花、小麦、油菜等人工合成四倍体的研究，为理解这种表型变异的机制提供了线索。初步结果表明，无论同源多倍体还是异源多倍体化后，既有基因的甲基化也有基因的脱甲基化，某些甲基化状态的改变可以重复且独立发生。这些甲基化了的基因可以用azadC再激活。利用多倍体产生的甲基化突变体将有助于进一步研究这一过程的分子机制。本文讨论了利用同源四倍体水稻产生二倍体的基因缺失与沉默突变体的可能性。