【目的】通过全基因组关联分析，定位影响杜长大商品猪肌内脂肪含量的相关SNP位点及其重要候选基因，为利用分子生物学方法改良猪肌内脂肪含量提供科学依据。【方法】选取981头杜长大商品猪，包括阉割公猪447头、母猪534头，所有试验猪均在统一条件下饲养至150日龄后进行屠宰测定，屠宰后利用索氏浸提法对肌内脂肪含量进行测定。利用GeneSeek GGP 50K芯片进行基因分型，使用rMVP软件包的FarmCPU模型对肌内脂肪含量性状进行全基因组关联分析。【结果】杜长大商品猪平均肌内脂肪含量达2.27%，其变异系数为34.24%，基因组遗传力（h2）为0.39，属于中等遗传力性状，表明该性状具有较大的遗传改良空间。经质控后，剩余30600个SNPs位点用于全基因组关联分析，共发现有8个潜在SNPs位点与肌内脂肪含量相关，分别分布在2、3、5、11、12、13和14号染色体上。利用Gene Ontology数据库对可能影响肌内脂肪含量的候选基因进行GO功能注释分析，发现这些候选基因参与的代谢通路包括肌肉发育代谢过程、器官生长代谢、基因表达调控及RNA转录等生物学代谢过程，但主要以肌肉生长发育代谢通路为主，表明肌内脂肪含量与肌肉生长发育之间存在紧密联系。【结论】利用高密度芯片进行全基因组关联分析，发现有8个SNPs位点与肌内脂肪含量相关；根据基因生物学功能及相关研究文献，C2orf74、HS6ST3和ROBO2基因主要参与细胞增殖分化及脂肪代谢等生物学过程，可作为影响肌内脂肪含量的重要候选基因。