代表性差异分析比较两株来自不同地区的猪源Lactobacillus菌株

来源 :微生物学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zhiyin1976
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【目的】对分离自猪肠道的乳酸杆菌S1菌株进行鉴定,并比较该菌株与同种的001T菌株的基因差异。【方法】对S1菌株进行16SrRNA基因序列分析和种特异PCR检测,并且对S1菌株和Lactobacillus sobrius 001T进行代表性差异分析(Representational difference analysis,RDA)。【结果】16SrRNA基因序列分析表明,与S1菌株最相似的已知菌为L.sobrius。变性梯度凝胶电泳分析显示,仔猪空、回肠细菌图谱中有一与S1菌株有相同迁移位置的优势条带,克隆、测序鉴定表明,与该条带相匹配的16SrRNA基因克隆(CloneS)的最相似已知菌也为L.sobrius。16SrRNA基因系统进化分析表明,S1菌株与CloneS和L.sobrius16SrRNA基因序列同源性分别为99.8%和99.6%。L.sobrius特异性引物也可以扩增S1株菌的16SrRNA基因的特定片段。因此S1菌株可被确定为L.sobrius。RDA对菌株S1和同种的猪源L.sobrius001T菌株的基因差异进行分析,未发现这两株菌的基因组差异。【结论】猪肠道乳杆酸菌S1菌株属于L.sobrius,其与猪源L.sobrius001T菌株为相似菌株。
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